Действие игры происходит через некоторое время после возвращения из Эдораса.
После возвращения в гильдии установилась обычная для неё весёлая атмосфера. Но долго ей радовать магов было не суждено. Потому как постепенно, словно вырастая из тумана, на горизонте появлялись новые враги. А значит, новые проблемы, новые беды, новые сражения…много всего нового, в чем стоит поскорее разобраться. Но в этот раз Фейри Тейл, да и, в общем-то, не только им, угрожает действительно серьезная опасность.
Если раньше безопасности фейритейловцев могли угрожать небольшие группировки, тёмные гильдии, например, то сейчас врага было много и в значении количества, и в значении качества. И несмотря на то, что официально это была всего лишь одна гильдия, на самом-то деле это было совсем не так.
На самом же деле, то, что кажется Сердцем Гримории, есть объединение побежденных врагов Фейри Тейл, мечтающих отомстить, а потому примкнувших к одной из сильнейших тёмных гильдий. Здесь и Орасион Сейс, хоть и не в полном составе: Хотей, Энжел и Кобра отказались, не захотели и дальше приносить зло. И, если первый сейчас находится в тюрьме, искупая тем свою вину, и мечтает встретиться с братом, то последние стали просто путешествующими по Фиору магами, придерживающимися светлой стороны. Также к Гримории присоединились сильнейшие маги Эйзенвальда и немало представителей других гильдий, пользующихся не очень хорошей славой.
И вся эта команда затеяла расправу над магами самой весёлой в Фиоре гильдии! Что же делать? Связываться с представителями дружественных гильдий, таких как Голубой пегас и Чешуя Сирены и, конечно, готовиться абсолютно ко всему – как морально, так и физически.
Но для начала надо узнать о существовании опасности, и что им грозит. Ведь кто знает, что ещё скрывает от нас темная сторона. А пока мир живет в гармонии с природой, не подозревая, что ж все-таки их ждет дальше. Если война, то она затронет каждого, а значит задаешься вопросом: "что делать и как избежать такого поворота судьбы?"